Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP29O95721 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms