Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSL3O95573 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL3O95573 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL3O95573 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1322.4 ms