Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFASCO94856 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFASCO94856 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFASCO94856 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFASCO94856 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFASCO94856 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFASCO94856 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFASCO94856 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFASCO94856 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFASCO94856 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFASCO94856 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFASCO94856 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFASCO94856 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFASCO94856 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFASCO94856 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFASCO94856 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFASCO94856 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFASCO94856 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFASCO94856 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFASCO94856 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFASCO94856 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFASCO94856 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFASCO94856 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFASCO94856 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFASCO94856 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFASCO94856 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFASCO94856 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NFASCO94856 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NFASCO94856 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFASCO94856 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFASCO94856 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFASCO94856 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFASCO94856 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFASCO94856 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFASCO94856 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFASCO94856 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFASCO94856 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFASCO94856 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFASCO94856 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFASCO94856 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFASCO94856 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFASCO94856 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFASCO94856 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFASCO94856 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFASCO94856 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFASCO94856 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFASCO94856 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFASCO94856 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFASCO94856 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFASCO94856 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFASCO94856 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NFASCO94856 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFASCO94856 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFASCO94856 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFASCO94856 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFASCO94856 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFASCO94856 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFASCO94856 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFASCO94856 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFASCO94856 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFASCO94856 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFASCO94856 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFASCO94856 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFASCO94856 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFASCO94856 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFASCO94856 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms