Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA2O75334 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA2O75334 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms