Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH16O75309 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH16O75309 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH16O75309 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH16O75309 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH16O75309 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH16O75309 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH16O75309 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH16O75309 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH16O75309 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH16O75309 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH16O75309 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH16O75309 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH16O75309 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH16O75309 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH16O75309 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH16O75309 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH16O75309 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH16O75309 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH16O75309 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH16O75309 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH16O75309 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH16O75309 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH16O75309 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH16O75309 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH16O75309 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH16O75309 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH16O75309 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH16O75309 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH16O75309 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH16O75309 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH16O75309 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH16O75309 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH16O75309 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH16O75309 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH16O75309 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH16O75309 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH16O75309 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH16O75309 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH16O75309 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH16O75309 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH16O75309 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH16O75309 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH16O75309 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms