Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED4O75132 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED4O75132 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZBED4O75132 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZBED4O75132 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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