Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF3O75054 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF3O75054 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms