Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN2O60636 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN2O60636 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms