Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSPAN1O60635 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN1O60635 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN1O60635 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms