Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
EXTL3O43909 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms