Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LANCL1O43813 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LANCL1O43813 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms