Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRY3O43610 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPRY3O43610 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRY3O43610 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRY3O43610 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRY3O43610 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPRY3O43610 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms