Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD51CO43502 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD51CO43502 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms