Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPSS1O43252 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPSS1O43252 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms