Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PJA2O43164 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PJA2O43164 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PJA2O43164 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PJA2O43164 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA2O43164 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA2O43164 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA2O43164 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA2O43164 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA2O43164 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PJA2O43164 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PJA2O43164 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA2O43164 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA2O43164 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA2O43164 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA2O43164 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA2O43164 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PJA2O43164 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PJA2O43164 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PJA2O43164 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA2O43164 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA2O43164 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA2O43164 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PJA2O43164 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PJA2O43164 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PJA2O43164 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA2O43164 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA2O43164 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA2O43164 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA2O43164 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA2O43164 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PJA2O43164 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA2O43164 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA2O43164 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA2O43164 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA2O43164 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA2O43164 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA2O43164 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PJA2O43164 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PJA2O43164 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA2O43164 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA2O43164 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA2O43164 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA2O43164 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PJA2O43164 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA2O43164 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA2O43164 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA2O43164 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA2O43164 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA2O43164 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms