Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASKO14936 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASKO14936 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASKO14936 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASKO14936 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASKO14936 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASKO14936 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASKO14936 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASKO14936 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASKO14936 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASKO14936 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASKO14936 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASKO14936 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASKO14936 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASKO14936 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASKO14936 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASKO14936 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASKO14936 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASKO14936 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASKO14936 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASKO14936 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASKO14936 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASKO14936 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASKO14936 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASKO14936 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASKO14936 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASKO14936 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASKO14936 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASKO14936 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASKO14936 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASKO14936 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASKO14936 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASKO14936 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASKO14936 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASKO14936 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASKO14936 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASKO14936 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASKO14936 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASKO14936 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASKO14936 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASKO14936 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASKO14936 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASKO14936 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms