Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP3O14828 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms