Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPEO14579 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPEO14579 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPEO14579 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPEO14579 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPEO14579 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COPEO14579 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPEO14579 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPEO14579 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPEO14579 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPEO14579 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPEO14579 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPEO14579 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPEO14579 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPEO14579 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPEO14579 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPEO14579 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPEO14579 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPEO14579 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPEO14579 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPEO14579 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPEO14579 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPEO14579 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPEO14579 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPEO14579 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPEO14579 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPEO14579 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPEO14579 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPEO14579 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPEO14579 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPEO14579 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPEO14579 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPEO14579 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPEO14579 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms