Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRIT1O00522 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRIT1O00522 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms