Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3KRW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KRW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
J3KRW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
J3KRW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
J3KRW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
J3KRW8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
J3KRW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KRW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3KRW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3KRW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3KRW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3KRW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3KRW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3KRW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3KRW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KRW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3KRW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3KRW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3KRW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3KRW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3KRW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms