Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms