Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3LH3BV60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TGFBR3LH3BV60 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGFBR3LH3BV60 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms