Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA8SH3BPF8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8SH3BPF8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms