Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PBE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PBE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PBE3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PBE3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PBE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PBE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PBE3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PBE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
E9PBE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E9PBE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PBE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PBE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PBE3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PBE3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PBE3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PBE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PBE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PBE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PBE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PBE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PBE3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PBE3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PBE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PBE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PBE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
E9PBE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PBE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PBE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PBE3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PBE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PBE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PBE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PBE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms