Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C9orf172C9J069 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf172C9J069 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms