Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF487B1APH4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF487B1APH4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF487B1APH4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms