Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UPK3BL1B0FP48 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPK3BL1B0FP48 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms