Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A8MVJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A8MVJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A8MVJ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A8MVJ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A8MVJ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A8MVJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A8MVJ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A8MVJ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A8MVJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A8MVJ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A8MVJ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A8MVJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A8MVJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A8MVJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A8MVJ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A8MVJ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A8MVJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A8MVJ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A8MVJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A8MVJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A8MVJ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A8MVJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A8MVJ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A8MVJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A8MVJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A8MVJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A8MVJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A8MVJ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A8MVJ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A8MVJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A8MVJ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A8MVJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A8MVJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A8MVJ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A8MVJ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A8MVJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A8MVJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A8MVJ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A8MVJ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A8MVJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A8MVJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A8MVJ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A8MVJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A8MVJ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A8MVJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A8MVJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A8MVJ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A8MVJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms