Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VGLL3A8MV65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VGLL3A8MV65 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms