Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms