Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC78A2IDD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC78A2IDD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC78A2IDD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms