Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM129A0AVI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM129A0AVI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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