Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBV5S2A0A599 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV5S2A0A599 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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TCRBV5S2A0A599 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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TCRBV5S2A0A599 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S2A0A599 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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