Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0U1RQJ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQJ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQJ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms