Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms