Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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KCNIP3Q9Y2W7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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KCNIP3Q9Y2W7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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KCNIP3Q9Y2W7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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KCNIP3Q9Y2W7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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KCNIP3Q9Y2W7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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KCNIP3Q9Y2W7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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KCNIP3Q9Y2W7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNIP3Q9Y2W7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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