Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL20Q9Y2M5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms