Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGSF9BQ9UPX0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms