Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms