Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXL4Q9UKA2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms