Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK3Q9UBP4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms