Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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