Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms