Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUCLA2Q9P2R7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms