Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARHGAP28Q9P2N2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms