Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHRF1Q9P1Y6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHRF1Q9P1Y6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms