Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL28Q9NXS3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms