Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDE1Q9NXR1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms