Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATAD3AQ9NVI7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms