Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED17Q9NVC6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms